1990m. Istorija su istorikais: [Pokalbis su Lietuvos MA Lietuvos istorijos inst. Dir.V.Merkiu/Užrašė]Antanas Matinkas // Gimtinė. - 1990, p.12. Istorijos ratui pasisukus: [Pokalbis su Lietuvos Respublikos MA istorijos inst. dir.V.Merkiu/Užrašė] Alytė Andrašiūnienė//Liet. Aidas. - 1990,Rugs.21,p.5. 1991m. Vyskupo Motiejaus Valančiaus kvotos klausimai 1871m.//Lituanistica. - 1990, Nr. 3, p. 51-66. Lietuvos istorijos metraštis / Lietuvos MA, Istorijos institutas, red. kol. Vytautas Merkys (vyr. red.) ir kt., // Mokslas. – 1990, p. 131-132. Merkys, Vytautas, Biržietytė, Gražina. Problemų daug. Kaip jas spręsime?:[Reportažas iš pirmosios Lietuvos mokslininkų sąjungos konf., Vilnius] // Mokslo Lietuva. - 1991, Nr. 8. “Lietuva atgims dvasia”:[Apie 1863 sukilimo dalyvę A. Sierakauskienę, 1841-1915] // Mokslas ir gyvenimas. - 1991, N 6, p. 4-5. Lietuvos žydų spaustuvės 1795-1915m.// Liet. Jeruzalė. - 1991, rugpjūtis. Lietuvių nacionalinis judėjimas ir polonizacija bei rusifikacija [XIX-Xxa.pr.]//Kult. Barai. - 1991, N 9, p. 56-60. 1992m. Yla, Stasys. Žmonės ir žvėrys Dievų miške: Kaceto pergyvenimai/[Baig. str. “Stasys Yla ir jo atsiminimai”, Vytauto Merkio], Šviesa. – 1991, p. 388-398. Konstantinas Jablonskis:[Istorikas] 1892-1960, K., Šviesa. - 1991, p. 144. Lietuvos nacionalinės retrospektyvinės bibliografijos redakcinės kolegijos narių kreipimąsis:[dėl Lietuvos knygų rūmų likimo]/V. Merkys, D. Kaunas ir kt. // Liet. Aidas. - 1992, vas. 22, p. 9. Lietuvos istorijos metraštis / Lietuvos MA, Istorijos institutas, red. kol. Vytautas Merkys (vyr. red.) ir kt. //Mokslas. – 1991, p. 207-208. Nežinomi 1906-1917m. Rygos Lietuvos spaudiniai // Mūsų praeitis. - 1992, N 2, p. 49-54. Vyskupas Motiejus Valančius:[Apie M. Valančius kovą su caro valdžia dėl liet. knygų spausdinimo] // Mokslas ir gyvenimas. - 1992, N 8, p. 6-7. Istorija ir tautinė kultūra // Var. nauji